一部记录名侦探柯南和海东小子之间对抗的电影，包括用新的动画重拍海东小子首次亮相。

　　召集了各个分野上的超一流的高中生，为培育他们成长而设立的政府公认特权学园「私立希望之峰学园」。在这个学园，存在着云集了超高校级的才能的"本科"，与只要支付了高额学费就谁都能够入学的"预备学科"两个学科。 不仅仅是才能，连性格也充满了个性的第77期本科生。他

　　曾经，埼玉（古川慎 配音）只是一介平凡的上班族，某日，在偶然之中遇见了遭到变种螃蟹攻击的少年，心中升腾起了正义之感，对其出手相救。就此之后，埼玉幼年时代的英雄梦想在内心里死灰复燃，为了变得更加强大，埼玉开始了艰苦的训练，一晃眼数年过去，他仿佛脱胎换骨般的获得了异常强大的力量，但却付出了变成光头的

在一个魔法消失后的时代，公主阿莱蒂（桑岛法子 配音）独自居住在高高的城堡塔楼里，等待来迎娶她的骑士。而国王为了从众多人选中选出驸马，提出只要谁能将魔法师的宝贝带回来，谁就可以取公主做新娘。时光荏苒，公主每天以书本来消磨时间。一晚，一位勇士偷偷溜进了公主的闺房，向公主示爱 ，可被公主回绝了。打发走了拜

东京东渡线地铁开通当天，发生了针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击，导致东渡线列车受损。经过一番推理，柯南等人认定这与八年前由朝仓主持的北知泽大坝建设有关。为了修建大坝，朝仓动员北知泽村的人搬入新村，但很多人直到最后阶段仍在抵抗。为了查明，柯南、芦原(めぐみ林园配音)、少年侦探团和理查德·摩尔(小山理

在漆黑的夜晚，一名间谍潜入日本警察机关，了记录各国间谍机关重要数据的绝密文件绝密资料。日本警方和联邦调查局特工赤井秀一(由池田秀一配音)立即追捕这名间谍。最后，逃犯 他的车掉下了悬崖。第二天，柯南(高山南配音)和他的朋友们参观了杜东水族馆，发现了一个美丽的受伤的女人(蓝泽优希·阿玛配音)。女子处于失

东京、大阪和京都都发生了谋杀案，五名死者都是被蒙面黑人用山城和弓箭瞬间杀死的。警方介入调查后发现，死者都是专门在三个地方盗窃著名佛像和艺术品的盗窃集团“源氏萤火虫”的成员。团里有8个成员，以易经大臣的名字互相称呼，都拿着一把《义经记》，5个受害者手中的《义经记》被抢走。这一天，京都的古寺善能寺收到了

柯南在街上目睹了一名正在打的警察在雨中被枪杀。他试图追踪凶手，但凶手逃脱了。受害者闭上眼睛，抓了一下自己的左胸，似乎暗示了什么。事后，柯南从警官蒋木木口中得知，抓住左胸是暗示那里有一本警察手册。很快又有一名警察在地下车库中枪，手里拿着一本警用手册。对于这两起案件，警官牧牧等人一反常态地不愿意向毛利小

柯南、足原诚司和少年侦探队的成员步美博士、广彦博士、元太岁博士这一天露营完毕，绕道去参观富士山前新建成的西多摩日本第一双子塔。毛利小五郎还被双子塔的主人和他的师妹张攀邀请参加开幕式。在若松美雪 经人介绍，他们认识了以画富士山而闻名的画家，如岳风水、市议员、双子塔的设计者、秀彦(森谷帝二，森谷曾在第一