十四年前，第一只号角疑似神化的第一形态的觉醒，带来了近三次冲击，让世界发生了前所未有的变化。之后，三户葛城和其他NERV总部的人逃跑了，并建立了抵抗瑟尔和NERV的威尔。威尔委托明日香(由段丽阳·宫村配音)和李珍(由坂本真绫配音)夺回被封在卫星轨道上的号角机和Shinji Ikari(由绪方惠美配音